En 1988, Merk debutó en la Bundesliga como el árbitro más joven en la historia de dicha competición. De este modo, como hemos podido observar, el Leipzig dejaba dicha zona desprotegida con frecuencia. Practicó su oficio de dentista hasta el año 2005 debido a su oposición a algunas políticas gubernamentales sobre dicha profesión. Participó con la selección española sub-21 en la Eurocopa Sub-21 de 2019 que ganaron y marcó un gol en la victoria por 4-1 en la semifinal sobre Francia. ↑ Clark, Gill. «Marc Roca, Spain Advance to 2019 U21 Euro Final with 4-1 Win vs. ↑ «Classy Spain sink Germany to lift Euro Under-21 Championship». ↑ «España – Marc Roca – Soccerway». ↑ «BAYERN MUNICH MIDFIELDER MARC ROCA TO JOIN LEEDS UNITED» (en inglés). ↑ «Lewandowski helps Bayern into last 16». BBC Sport (en inglés británico). France». Bleacher Report (en inglés). Werder Bremen 1 – 1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
Friburgo 0 – 1 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última). Debutó en la Primera División de Argentina el 2 de septiembre de 2001 en un partido contra Estudiantes de La Plata. Actualmente dirige al C. A. River Plate de la Primera División de Argentina. Como director técnico, dirigió a Bayern de Múnich II de 2020 a 2023. Fue contratado por River Plate en 2023, donde ganó el Campeonato de Primera División. En 2000 llegó a River Plate. Merk fue insultado y atacado físicamente por hinchas del Schalke y desde ese momento, Merk nunca ha arbitrado en el Veltins-Arena. De momento, sin éxito. Cuando Schalke ya había ganado su partido y el HSV superaba por 1:0 a su rival, Merk cobró un tiro libre indirecto a los 93′ a favor de los bávaros y que resultaría en el gol de Patrik Andersson que le daría el título a su equipo.
Previo al partido final, Bayern Múnich superaba al Schalke 04 por tres puntos, aunque este último tenía una mejor diferencia de goles. En la temporada 2019-20, se volvía a jugar el derbi contra el Waldhof Mannheim tras 18 años con el ascenso de este último este partido tuvo una asistencia de 36.760 espectadores, el resultado fue 1:1. En la DFB-Pokal, el sorteo lo emparejo con su máximo rival de la región el Mainz 05 siendo un club de primera, al que derroto sorprendentemente por 2:0 de esta forma accedió a segunda ronda donde derrotaron al Núremberg en penales tras empatar 2:2, aunque finalmente serían derrotados por otro de sus rivales de la región el Saarbrücken en penales. Tras dicho partido, su participación acabó al no ser elegido por la FIFA para arbitrar durante la segunda ronda. Australia (donde fue acusado por Harry Kewell de ser «probrasileño») y en el Ghana vs. Su carácter y capacidad goleadora lo llevaron, tras apenas dos años, a ser capitán del club a partir de la temporada 2009-10, siendo el primer futbolista sudamericano en lograrlo.
Para la temporada 2013-2014 fichó por el BC Enisey Krasnoyarsk ruso, pero en mayo de 2014 deja el equipo y vuelve a la ACB, fichando hasta final de temporada por el Laboral Kutxa. Una de las pocas polémicas fue durante la final de la temporada 2000/2001 de la Bundesliga. Se enfrenta a su Bayern, con el que disputó 117 partidos, marcó nueve goles, repartió 12 asistencias y conquistó cinco títulos a las órdenes de Pep Guardiola entre 2014 y 2017. Sin embargo, esta tarde, en el BayArena, camisetas racing de santander no habrá amigos. El 26 de abril de 2006, Markus Merk fue designado para arbitrar el partido de vuelta en el Camp Nou por las semifinales de la Liga de Campeones de la UEFA 2005-06 entre el F. C. Barcelona y el AC Milan. El 19 de mayo de 2012, anotó un gol en la final de la Liga de Campeones de la UEFA 2011-12, ante el Chelsea FC, pero su equipo acabaría perdiendo en la tanda de penaltis. El partido fue muy estancado, con un único gol en el minuto 57 por obra de Angelos Charisteas. El Borussia Mönchengladbach ha empatado a un gol en su visita a Hamburgo en la tarde del domingo en el partido correspondiente a la 22ª jornada de la Bundesliga de Alemania.